Zgodnie z Rozporządzeniem Ministra Pracy i Polityki Społecznej w sprawie rocznego sprawozdania merytorycznego z działalności organizacji pożytku publicznego, Fundacja Edukacji Międzynarodowej od 2012 roku publikuje sprawozdania tylko według wzoru właściwego dla sprawozdań organizacji pożytku publicznego.

Od 2007 roku, zgodnie z § 27 ust. 3 Statutu, rok obrotowy Fundacji trwa od dnia 1 sierpnia do dnia 31 lipca roku następnego.

Sprawozdanie finansowe zatwierdza Rada Fundacji do końca szóstego miesiąca od dnia zakończenia roku obrotowego (zgodnie z art. 53 ust. 1 ustawy o rachunkowości). Fundacja Edukacji Międzynarodowej, jako organizacja pożytku publicznego, publikuje sprawozdanie merytoryczne i zatwierdzone sprawozdanie finansowe w internetowej bazie sprawozdań prowadzonej przez Narodowy Instytut Wolności w ciągu 15 dni od daty zatwierdzenia sprawozdania finansowego (zgodnie z art. 23 ustawy o działalności pożytku publicznego i o wolontariacie).